同作といえば、これまで少年サンデーコミックス、ワイド版、文庫版にて出版されてきたが、愛蔵版では『週刊少年サンデー』連載当時のカラー原稿がすべて再現。A5の大判にて刊行された点が特徴だ。これまでのコミックス化において、物語のつながりを重視して縮小して掲載されていた扉絵も「扉絵ギャラリー」として復刻。キャラクターの人物像が垣間見えるシーンを改めて楽むことができる。
さらに、連載が始まる前に描かれた創作ノートからメカイラストが抽出。「コンセプトアート集」も巻末に収録される。さらに、愛蔵版ならではの工夫として、特製の函入りの特別仕様が採用。各巻の函に掲載している線画は、ゆうきまさみが愛蔵版のために描き足しを行ったものとなっている。『機動警察パトレイバー』愛蔵版第1巻は、現在発売中。